KAIKObase gene description page [BMgn005346/Gene04477]

Outline

Official gene ID BMgn005346
Local gene ID Gene04477
Chromosome chr8
Start (Chr.) 10404113
End (Chr.) 10418330
Scaffold Bm_scaf19
Start (Scaf.) 3239996
End (Scaf.) 3254213
Direction -

Member sequences

ID Type Representative
AK386910 full-length cDNA No
AK382033 full-length cDNA Yes
AK382019 full-length cDNA No
BGIBMGA005346 predicted gene No

Representative sequence

Nucleotide

 GAATATGTGCTTGCTTTTATTTTTATTGATCTGAAATCTGAGTAAAAGATGATAAAAGCGATTAACGGAGTGTTTATTTACATTTTTTGAATCTGAATTTGAACTAACGAATTAAAATAAAAATGAATTTTTCACCTGGTACAGTGCAAATTTTACAATTCATTCAAAATGATTGGAAGTTAATATTGATTTTAACTCTTCTAATATTTATTTACTACTACTACACAAATACATTTGATTATTTTGAAAAAAGAGGTGTTCCGTTTAAGAAACCTATTATTTTTCTTGGAAATCTTGGACCGCGTTTGAAAGCCGCAAAGTCGTTTCACCAATACCAATTGGATATCTACCAATATTTTAAAGGTCATCCATACGGCGGTACCTTTGATGGAAGACGTCCAGTTCTACATATTTTAGATCCTGAGCTTATTAAAGCTATAATGATCCGGGATTTTGATCATTTTACTGACCGTAACACTTTGAACAGTATGGAACCACGATATCTGAGTCGGTCTTTGCTAAATTTAAAGGGCTTAGAATGGAAAGGCGTTCGCAGCACATTAACACCTGCCTTCAGCTCATCACGCTTAAAAAATATGATTCCACTCATACAACAGTGTTCTAAGCAGATGGTCGAATTTCTCAGGAAATTTGATGGGAAAGAAATTGAAATGAAACAAACAATGGGTCATTTCACATTAGAAGTTATCGGTGCTTGCGCATTTGGTATTAAATGCGACGCTTTGAGTAATGAGAATTCACGATTTGTCAAAGTCGCAGAAAAGTTCGACTACATGCCCAAATACAAACGAGTTATATTACTCATGTTATTAGTATTTATGCCTAAAATGATCAGATACCTCCGGCTATCGTTTCTGAATATTGAATATACCGGAGAATTAGTGAGAATGCTACAAGCAGCCAAAGCTGAAAGACGATCTTCAGAGTCAAAGAAAGGAGACTTCCTACAGGTTCTTATTGATTTCGCTGCAAAAGAAACTGCGCAAAACGATACGGCTAAACGGGAAATACTTCTGGACGATGATACGATCGATGCACAGAGCCTGTTATTCTTGATAGCTGGATACGAGACTTCCAGTACCCTGCTATCGTTCGCTATCCACGTACTGGCCACTAAACCTGATTTGCAAGAGACCCTGCGTGCTCACGTTCAAGAAATGACAAAGGGAAAAGAATTGAGCTATGAATTGTTGTCGCAAATGGATTACCTAGAAGCATTCCTTCAAGAAACTCTCCGCATATATCCGCCAGTGGCTCGAGTGGATCGTATCTGTACGAAGCCCTACATAATTCCAGGAACGACAGTACATGTAGGTGTCGGTGATGCTGTAGCCATCCCCGTGTACGGTTTGCACATGGACGAGGATATATATCCGGAACCAAGAGAATTCAAGCCGGAACGATTCATGGACGATCAGAAAAAAGATAGGCCTTCACATTTGTACCTGCCTTTTGGTGCAGGACCTAGAAACTGTATAGGCTTAAGATTCGCCATGATTTCCGCGAAAATAGCAATGGTCGCTTTAATGAAAAATTTCAAATTTTCTGTGTGTTCAAAAACAATGGATCCCACTGATTTCGATAAGAGAGCTGTTTTGCTGAAATCAGCCAAAGGATTGTGGGTTCGTATTGAATTAATTGATCTTTCCTAATTACGACACGAATGGAATAGTGGTGTAGGTTAATGATAGATAACAAACACGGGGTAAAACAAGGTTTAGAATAAAAATACAGTATTCCTATTAATTACGAGCATCATGTATGTGTAATTGTGATAATATAAACTTGCCATTTTAATATGAATGTTACAAAAGAGATTGTGATAAAGAACAAACTATATAAGTAATTTATTTTCTCACTGTATTAATAATAGGAAATCTATAATTCTTACAATATAAGAATTTTTATTTTGTACAATTATAGGATTAAGTAGAGGGATTTATTTCAAATGTTTGAACGGTGATATTATATTGTTTATTACTTTATGTTTATTATCCTTAACGTTGAAATTGACTTAATGGGTTTTTAATGAAACCGTGACGTTTAGGCAAGTACCATATTGTATTTAGCCATACGGGTGACGTCATCACATTTATTTCCTTCAAAATAAATATAAATAGACGATTTAAAAAGATTTTCATGTGATAAAAAAATATACATTTATATAATTTCCATTTTGAAATGTTAATTAGTGCTCGTAAAATTAAATTATATCCCTATTGGATATATTAATAAATATATACTCGATGTTTACTGATGACTATAGGCATAAAAAATAATATAATTATTAACTATGAGATTTCGTTAACAATTTAGAAGTATGTATTAAAATAAAATTGTTTCATTTTTATCTCTTTTATAATGTTAAATGTTGGTAAAGGTTAATATTATTAAATAATAAAAGACGTGGTCACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 

ORF

 ATGAATTTTTCACCTGGTACAGTGCAAATTTTACAATTCATTCAAAATGATTGGAAGTTAATATTGATTTTAACTCTTCTAATATTTATTTACTACTACTACACAAATACATTTGATTATTTTGAAAAAAGAGGTGTTCCGTTTAAGAAACCTATTATTTTTCTTGGAAATCTTGGACCGCGTTTGAAAGCCGCAAAGTCGTTTCACCAATACCAATTGGATATCTACCAATATTTTAAAGGTCATCCATACGGCGGTACCTTTGATGGAAGACGTCCAGTTCTACATATTTTAGATCCTGAGCTTATTAAAGCTATAATGATCCGGGATTTTGATCATTTTACTGACCGTAACACTTTGAACAGTATGGAACCACGATATCTGAGTCGGTCTTTGCTAAATTTAAAGGGCTTAGAATGGAAAGGCGTTCGCAGCACATTAACACCTGCCTTCAGCTCATCACGCTTAAAAAATATGATTCCACTCATACAACAGTGTTCTAAGCAGATGGTCGAATTTCTCAGGAAATTTGATGGGAAAGAAATTGAAATGAAACAAACAATGGGTCATTTCACATTAGAAGTTATCGGTGCTTGCGCATTTGGTATTAAATGCGACGCTTTGAGTAATGAGAATTCACGATTTGTCAAAGTCGCAGAAAAGTTCGACTACATGCCCAAATACAAACGAGTTATATTACTCATGTTATTAGTATTTATGCCTAAAATGATCAGATACCTCCGGCTATCGTTTCTGAATATTGAATATACCGGAGAATTAGTGAGAATGCTACAAGCAGCCAAAGCTGAAAGACGATCTTCAGAGTCAAAGAAAGGAGACTTCCTACAGGTTCTTATTGATTTCGCTGCAAAAGAAACTGCGCAAAACGATACGGCTAAACGGGAAATACTTCTGGACGATGATACGATCGATGCACAGAGCCTGTTATTCTTGATAGCTGGATACGAGACTTCCAGTACCCTGCTATCGTTCGCTATCCACGTACTGGCCACTAAACCTGATTTGCAAGAGACCCTGCGTGCTCACGTTCAAGAAATGACAAAGGGAAAAGAATTGAGCTATGAATTGTTGTCGCAAATGGATTACCTAGAAGCATTCCTTCAAGAAACTCTCCGCATATATCCGCCAGTGGCTCGAGTGGATCGTATCTGTACGAAGCCCTACATAATTCCAGGAACGACAGTACATGTAGGTGTCGGTGATGCTGTAGCCATCCCCGTGTACGGTTTGCACATGGACGAGGATATATATCCGGAACCAAGAGAATTCAAGCCGGAACGATTCATGGACGATCAGAAAAAAGATAGGCCTTCACATTTGTACCTGCCTTTTGGTGCAGGACCTAGAAACTGTATAGGCTTAAGATTCGCCATGATTTCCGCGAAAATAGCAATGGTCGCTTTAATGAAAAATTTCAAATTTTCTGTGTGTTCAAAAACAATGGATCCCACTGATTTCGATAAGAGAGCTGTTTTGCTGAAATCAGCCAAAGGATTGTGGGTTCGTATTGAATTAATTGATCTTTCCTAA 

Protein

 MNFSPGTVQILQFIQNDWKLILILTLLIFIYYYYTNTFDYFEKRGVPFKKPIIFLGNLGPRLKAAKSFHQYQLDIYQYFKGHPYGGTFDGRRPVLHILDPELIKAIMIRDFDHFTDRNTLNSMEPRYLSRSLLNLKGLEWKGVRSTLTPAFSSSRLKNMIPLIQQCSKQMVEFLRKFDGKEIEMKQTMGHFTLEVIGACAFGIKCDALSNENSRFVKVAEKFDYMPKYKRVILLMLLVFMPKMIRYLRLSFLNIEYTGELVRMLQAAKAERRSSESKKGDFLQVLIDFAAKETAQNDTAKREILLDDDTIDAQSLLFLIAGYETSSTLLSFAIHVLATKPDLQETLRAHVQEMTKGKELSYELLSQMDYLEAFLQETLRIYPPVARVDRICTKPYIIPGTTVHVGVGDAVAIPVYGLHMDEDIYPEPREFKPERFMDDQKKDRPSHLYLPFGAGPRNCIGLRFAMISAKIAMVALMKNFKFSVCSKTMDPTDFDKRAVLLKSAKGLWVRIELIDLS* 

Auto annotation result

Program/Analysis Accession Description Score/Expectation
Pfam/Hmmer3 PF00067.17 Cytochrome P450
BLASTP/NCBI-nr ADE05589 cytochrome P450 354A5 [Manduca sexta] 0.0
InterPro IPR001128 Cyt_P450
InterPro IPR017972 Cyt_P450_CS
InterPro IPR002401 Cyt_P450_E_grp-I
Gene Ontology(MF) GO:0009055 electron carrier activity
Gene Ontology(MF) GO:0020037 heme binding
Gene Ontology(MF) GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
Gene Ontology(MF) GO:0005506 iron ion binding
Gene Ontology(BP) GO:0055114 oxidation-reduction process

Expression data (EST count)

Paralog/Ortholog genes

Paralogous genes

Gene ID Official gene ID Chr. Chr. start Chr. end Scaffold ID Start End Direction

Orthologous genes

Species Gene ID Scaffold ID Start End Direction
D. plexippus DPOGS201665 DPSCF300103 409975 418382 -
H. melpomene HMEL012954 HE671989 218744 225168 +
M. sexta Msex002318-RA scaffold00027 1423472 1435354 -
P. xylostella Px014440.2 scaffold_629 18899 22438 -