KAIKObase gene description page [BMgn014599/Gene16546]
Outline
| Official gene ID | BMgn014599 |
|---|---|
| Local gene ID | Gene16546 |
| Chromosome | unknown |
| Start (Chr.) | ND |
| End (Chr.) | ND |
| Scaffold | Bm_scaf543 |
| Start (Scaf.) | 2656 |
| End (Scaf.) | 7111 |
| Direction | - |
Member sequences
| ID | Type | Representative |
|---|---|---|
| AK385438 | full-length cDNA | Yes |
| BGIBMGA014599 | predicted gene | No |
Representative sequence
Nucleotide
GAGAATATACACTTAATTTAGTGTGGAGTTATCACTGAATTACGATTAATGATAACGCAGATACAAAATGTCATGCATTGTGCAAGTTGAGCAGGGCTTATTGGAGGGAACGAAGCGTCAGAGCTGCCGTGGTCAGTATTACTACAGCTTTGAGGGAATACCGTATGCGAAGCCACCTATTGGAAAGCTGAGATTTAGTAATCCACAAGAACCCGATCAATGGAAAGGAATACGTAGCGCAAAAAGTCCCTCAAACAAATGCGCCCAATTAAATCCTTATTCTAACTCAGCGTTAGTAGGTTCGGAAGACTGTTTGTACTTAAACATTTACACACCTAGTTTGCCAGCTGAAAAACTCGAGAAATTACCAGTAATCTTCTTCGTCCACGGCGGTCGTTTGATTGTAGGCTACGGAGATTATTATACACCGGATTATTTGATTAAAAACGATGTTATTTTAGTAACGTTAAATTACAGGTTAAATGTGTTAGGATTTTTGTGTTTGAATTTACCGGAAGCACCTGGTAACGTTGGAATTAAGGACACCGTCTACGCATTACGTTGGGTCGGTAGAAATATTTCTCGTTTTAATGGCAACCCTGGTAATATAACGGTTTCCGGTGAAAGCGCCGGTGGGGCAATTGTATCTTCGTACTTAACCTCAAAGATGACTGTTGGTCTTTTTAGTAAGGTCATTGCGCAGTCCGGGAATTCAATATCAGATTTGTATTTGATTAACGAGGATCCTATTGAGAAAGCGATAAAATTGGCGTCAGTTTTAGGCAAGGATTTGAAAGATCAACGGTCTTTATACGAGTTCTTAGTACAGGTTCCGTTAGTAGATTTGGTGAATGCGTTCACCCAGCTAGAACTGAGTCGGCCGCCTAGTATTATCAATGCGTATTTCTTACCGGTCGTCGAGAAAAAGTTCGATAACGTCGAAAGTTTTTTCGAGGAACATCCCATAGTGTCCATTAAGAATAATAGAGTACAGAAAGTGCCCGTAATAACAGGTTATACCACTTACGAATCAGCGCTGTTCGTCCAAAAAGACTACTCCGGTAGGATCGTATATGTAGATGACTTTCATAATTTTATCCCTCGATTCTTGGGTGTCGAAAAGAACACGGAAAGATCTAGAGTTTTCCAGAAGAAACTACGCGAATTCTATTTTGCGGGCCGGGAATTGAATGACGATTTGAAGATTGATTATTTGGTAATGATCACGGACGTGTATTTCGTTAGGGATATCATTTATTTCGCTGAATTACTATCAAAACACAATCCTGAGGTGTATCTATATGAATTCGGTTTTGACGGCAACCTGAATACGAGGGTTATGAAGAGTTTGGGAGTGAAGGGAGCGTCGCACGGAGACATCGTGCAGTATCAGTTTTACAGGAAGAGCAAAGCAGAAAAATGCGGGGAGGCTGACGAGAGAACGATTGACTTCTTGAGCGAATGCTGGAGTAATTTTGCTAAATACGGCGTACCAACATGGAGGAATCAGAAAACAAAATGGCTGCCTTACTCAACGAACAATAGACGGACGCTAGTTATAAATGACGAGATAGAATTAAAGAGAGACGTTAATTTGAATCGCATTAAGTTCTGGTACGATATGATCAAGGATAAGAGTAAATTGTGAATTAATTAAAATTAAACGGTGGTGGTTATTTCATTGTGCCATTATTCAATGGTGGATAAAGAATGTAACACTATACTAGGGAAAAAGCGTATCACTCTCTATACAAAAATCATTTGATAGATATATTTAAGGCTGCCACTTCTCGAGCCGAAAGCTGAAATCGTCGACCGGGAAATCATTAATACCGCCCCAAGAAATAAAATACGCAGTAATGTACCTGATTTATGAAAAAAAAAACTTGAAAATCTGATGTGGAAAGCCTCGACTTTGGTAACAACTATAATGCCTTCGACTGACTCAGAATTAGGTTTGAAAAAAAAAGAACGCATGTATCCCAAAATTGATTAATATTTGCGTTTAAAAATAATTAGCGTGTAGAATTGTTTAATCCAAACAATGTTGATGTGAAACACCTATGCCGTACGTAAAACCGATTGATGGCGTGGCGACGCATCGCCATGCGCAAGCGACTGTTTCTTAATATTAAGATTTTATTTTTCATTATACCACATGAATTTCGTGTCGTAAGCCTTATCCGTATCCATTTATTTCCACCAACAAAGTGATCATCAATACAAAACAGTGACAAACTGTACAAAAGTACATAGCAGATGTCACCTCAATTATAAGTGCAATTGACAGCGCATTGACCTCTTGTGAGTTCACATGGGTAGGTACCACCACCTTGCCTATGAAGAGTGACCGTGTGAAGGGTGGGGCAGCCGTTGTAACTATACTGAGACCTTAGAACTTATATCTCAAGGCGGGTAGCGCATTTACAGTTGGAGATGTCTATGGGATCCAGTAACCACTTAACACCGGGTAGGCTATGGGGCTCATAGCTAGTCCACTCGTCTAAGCAATATATTTTTTTATATATTTATATATCTCGACTGCATTTGATTACATAAGCATGCATTGATTACTTTTGTGCATCTATACTTGTGTGCTTAGTGCGAGTTTTATGGAGTTTGAACAGCGCTCCTACGTTTGCAAATTTGAGTTAACTGTGTCCATAGTGCGAGTTTTTTAACGTTCTCGATAGCGTAAACGTGGAACGTTTGCCTACGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTCGAAGTCAATTCGATTTAACTTTTACGCTATCGATAACTTCATAAAACTCACACTAAGCACAATGCGCTGTTGAAATGTACTAATAAGCACGCGACACCTTTTTCGTTCCTACAAAAACTGTTGTGCTGACCTAATCTGAATCAGCTCTAACAGTACATGTTATAAGGTTATCTGAAGCAGTCTTCCATGAAATTTTCAAACAGATTCTAAAAAACTCGCGCCATTTGTGGCCGACCTCTGTGCATTGGCACTGGAATTGCCAGACGTCTCGGGACTCTGTCCCGTATTCGAAGCGTACGATTTTAATTGTATTGATTTTTATAAATATGTTAAAACCGATAAAAATATGTTAAAATTGACTTGCTCCTCGAAAAAATATCAATAAAGAAATAAAGATTGTCACTATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ORF
ATGTCATGCATTGTGCAAGTTGAGCAGGGCTTATTGGAGGGAACGAAGCGTCAGAGCTGCCGTGGTCAGTATTACTACAGCTTTGAGGGAATACCGTATGCGAAGCCACCTATTGGAAAGCTGAGATTTAGTAATCCACAAGAACCCGATCAATGGAAAGGAATACGTAGCGCAAAAAGTCCCTCAAACAAATGCGCCCAATTAAATCCTTATTCTAACTCAGCGTTAGTAGGTTCGGAAGACTGTTTGTACTTAAACATTTACACACCTAGTTTGCCAGCTGAAAAACTCGAGAAATTACCAGTAATCTTCTTCGTCCACGGCGGTCGTTTGATTGTAGGCTACGGAGATTATTATACACCGGATTATTTGATTAAAAACGATGTTATTTTAGTAACGTTAAATTACAGGTTAAATGTGTTAGGATTTTTGTGTTTGAATTTACCGGAAGCACCTGGTAACGTTGGAATTAAGGACACCGTCTACGCATTACGTTGGGTCGGTAGAAATATTTCTCGTTTTAATGGCAACCCTGGTAATATAACGGTTTCCGGTGAAAGCGCCGGTGGGGCAATTGTATCTTCGTACTTAACCTCAAAGATGACTGTTGGTCTTTTTAGTAAGGTCATTGCGCAGTCCGGGAATTCAATATCAGATTTGTATTTGATTAACGAGGATCCTATTGAGAAAGCGATAAAATTGGCGTCAGTTTTAGGCAAGGATTTGAAAGATCAACGGTCTTTATACGAGTTCTTAGTACAGGTTCCGTTAGTAGATTTGGTGAATGCGTTCACCCAGCTAGAACTGAGTCGGCCGCCTAGTATTATCAATGCGTATTTCTTACCGGTCGTCGAGAAAAAGTTCGATAACGTCGAAAGTTTTTTCGAGGAACATCCCATAGTGTCCATTAAGAATAATAGAGTACAGAAAGTGCCCGTAATAACAGGTTATACCACTTACGAATCAGCGCTGTTCGTCCAAAAAGACTACTCCGGTAGGATCGTATATGTAGATGACTTTCATAATTTTATCCCTCGATTCTTGGGTGTCGAAAAGAACACGGAAAGATCTAGAGTTTTCCAGAAGAAACTACGCGAATTCTATTTTGCGGGCCGGGAATTGAATGACGATTTGAAGATTGATTATTTGGTAATGATCACGGACGTGTATTTCGTTAGGGATATCATTTATTTCGCTGAATTACTATCAAAACACAATCCTGAGGTGTATCTATATGAATTCGGTTTTGACGGCAACCTGAATACGAGGGTTATGAAGAGTTTGGGAGTGAAGGGAGCGTCGCACGGAGACATCGTGCAGTATCAGTTTTACAGGAAGAGCAAAGCAGAAAAATGCGGGGAGGCTGACGAGAGAACGATTGACTTCTTGAGCGAATGCTGGAGTAATTTTGCTAAATACGGCGTACCAACATGGAGGAATCAGAAAACAAAATGGCTGCCTTACTCAACGAACAATAGACGGACGCTAGTTATAAATGACGAGATAGAATTAAAGAGAGACGTTAATTTGAATCGCATTAAGTTCTGGTACGATATGATCAAGGATAAGAGTAAATTGTGA
Protein
MSCIVQVEQGLLEGTKRQSCRGQYYYSFEGIPYAKPPIGKLRFSNPQEPDQWKGIRSAKSPSNKCAQLNPYSNSALVGSEDCLYLNIYTPSLPAEKLEKLPVIFFVHGGRLIVGYGDYYTPDYLIKNDVILVTLNYRLNVLGFLCLNLPEAPGNVGIKDTVYALRWVGRNISRFNGNPGNITVSGESAGGAIVSSYLTSKMTVGLFSKVIAQSGNSISDLYLINEDPIEKAIKLASVLGKDLKDQRSLYEFLVQVPLVDLVNAFTQLELSRPPSIINAYFLPVVEKKFDNVESFFEEHPIVSIKNNRVQKVPVITGYTTYESALFVQKDYSGRIVYVDDFHNFIPRFLGVEKNTERSRVFQKKLREFYFAGRELNDDLKIDYLVMITDVYFVRDIIYFAELLSKHNPEVYLYEFGFDGNLNTRVMKSLGVKGASHGDIVQYQFYRKSKAEKCGEADERTIDFLSECWSNFAKYGVPTWRNQKTKWLPYSTNNRRTLVINDEIELKRDVNLNRIKFWYDMIKDKSKL*
Auto annotation result
| Program/Analysis | Accession | Description | Score/Expectation |
|---|---|---|---|
| Pfam/Hmmer3 | PF07859.8 | alpha/beta hydrolase fold | |
| Pfam/Hmmer3 | PF00135.23 | Carboxylesterase family | |
| Pfam/Hmmer3 | PF00326.16 | Prolyl oligopeptidase family | |
| BLASTP/NCBI-nr | EHJ66042 | hypothetical protein KGM_00810 [Danaus plexippus] | 0.0 |
| InterPro | IPR019819 | Carboxylesterase_B_CS | |
| InterPro | IPR002018 | CarbesteraseB |
Expression data (EST count)
Paralog/Ortholog genes
Paralogous genes
| Gene ID | Official gene ID | Chr. | Chr. start | Chr. end | Scaffold ID | Start | End | Direction |
|---|
Orthologous genes
| Species | Gene ID | Scaffold ID | Start | End | Direction |
|---|---|---|---|---|---|
| D. plexippus | DPOGS201956 | DPSCF300384 | 13746 | 17937 | - |
| H. melpomene | HMEL002060 | HE667785 | 28855 | 32497 | + |
| P. xylostella | Px004046.1 | scaffold_164 | 534713 | 537025 | + |