KAIKObase gene description page [BMgn015619/Gene05566]

Outline

Official gene ID	BMgn015619
Local gene ID	Gene05566
Chromosome	chr10
Start (Chr.)	6874944
End (Chr.)	6877586
Scaffold	Bm_scaf10
Start (Scaf.)	6874944
End (Scaf.)	6877586
Direction	+

Member sequences

ID	Type	Representative
AK387870	full-length cDNA	Yes

Representative sequence

Nucleotide

 TAAATGAATTGACTTGATCGCTGGACGCCGCGCTGCGTCGGCGAAGACTCAGGTCCCCGCATCTCACAGCGCATGCTCGCCTGTATTCTGTTTACAAATTACGATATGCGGGCGCGCTGACTATTTTGCGGGGATTCAAACAATATTTTTCTTGCTTATCCCGTTATATGTGAATCAGTGACAATGTGGTTAAGTGTATTATTAGTGGTGATTTTACTGTTTTTGATTCTGTTGTTAACCGTGTTTCACTATACGACTAAAGGAAGAAAATATTGGTTGTTACGAAATGTACCTTACAGAGAACCATGTCCGTTATTTGGAAATTTTGGAGCAACGTTCACTATGAGGAGAAGCTACACAAAAATGTTGCAATTTTTTTACGATAATTATTATAATGAGAAATACGTGGGAATTTTTCAAGCACGGAGGCCGACATTAATGCTCATAGATTTAGAACTGGTGAAAAATGTATTATCTAAAGAATTTCCGAATTTCAGCGATCGCATATCTGTTACGACCGATACGCAGCGGGAACCATTGCTTCGGAATTTAGCTAATATGAGTGGAGCTGAATGGAAAGCTATGAGGCAGATTGTAACGCCAACATTTTCATCGGCGAAAATGAAAGCTATGTTTCCATTGATAGCGGAATGTGCTCAAACATTAAAAAATAGTCTACTTAAGGAGTCTCTCGCGGAAGTTAATGTGCCCGATTTTATGACACGATTTACTACAGACGTAATTGGTAGTTGTGCCTTCGGAGTCGACCCTGGTTCTCTGAAAGATCCCGAGTCTCCATTCTTAAAAATGTCGCAAAAAATGTTTAAAATTGATCGTTCTACTGTTTTAAAACGCTATTGTAGAACGTTTTTCCCAAAGCTGTTTAAATTTTTGAATCTCAGAACATACTCAAAGGATGTGGAAACGTTTTTCACAACTATTATTAAGAAAGTTCTCGATGAAAGGCGCGCCACGGGCGTTCAAAGACATGACTTCCTACAGCTTATGTTGAACGTTCAGAAAACTGAAACAAGTTTCGTTATGACCGACACATTGATAATATCGAATTCGTTCATTTTTATGCTCGCTGGACTAGAATCCTCGTCTACTACACTATCGTTCTGTTTATATGAATTGGCTAAAGATAAACACATCCAAGATGATCTCAGAACAGAGATTGTTGACTGCTTAGAAAGGTATGGTGGTATAAATTATGAAGCAGTGTGTTCAATGCGCTTGGTCAACCAAGCTGTACTTGAGACTTTACGACTTCATCCACCGACGCCGCTCACGACACGGCTTTGCACCAGTGCTTGTACTCTGAATGGCACAGATTTAAGCGTTAGAGTAAGAGATCCCGTGTTAATACCTTTGTATTGTATTCAGCGAGACGCCCAACACTTTCCTAATCCTGACAAGTTCAATCTAGAAAGGTTTAAGGAAACAAATCCTCCTGGATTTTTGGCTTTCGGCGAAGGACCGAGGAGTTGTCCAGGCGCACGATTTGCTCAATTGACAGTTGCCGCGGCTCTTGCGGCTTTGCTAAGTAGTTTTGAAATAGAACCTTGTTCCATGACAACTTCCACTATAGTCTATGATCCTAGAAGTGTAATGCTTAAGAATAAAGGCGGGATATGGCTGAAATTTGTACCTCTATAAATAAAAAATAAGTACTTAAATGTAAAGAAGTTCCAAGCATGTTAGTTTCTGAAGATGAATAAATAACGCTTTCCTTAATTAATTATAGTTTCAGTGTAGGTACTTAAATTTTTATCAATAACAATAAAACTATTTTATCACTTAAACTTGTTACTAATTTACTCATATTAATGTATCTTTGCAAAAAACATGTCGATAATTTGTTACCTTTTTAAAGGGACAGACAAACAAACATACTTCGTAATCACTGAACGCGTATAATTTTTTTCACGAAATAAGAATCCTATGTGATTCTGTCTCAGAAACAATCGGTATAAAAAGAAGGTTATTTGTTACCGCGTAAAAAAGCAACAGACCAATGAACACACTTGTGTTCATAATGATTCTATAATTATAATTCACTTCCGGTCGTTGTTATAATTTTTTGTGTCATTGTAATATAATGGTTTTACAGATGTGCGACGGTTTGTATAATGGTGTGTATGTACAAATAAATGTTTTGTTTGTTACATGCATTGATTGTATCGTTTGATGACCCCGAAAGGTATTGTTATGAAGTATTTCGTGGACGTCACTATTCGTTCATATATATATGTTACTTAATAGAATGTTACAGTATTTTAACATTTGGACCTGAATCGTAATATTTATTTTTTAAGTAGTACTATAGTAACTATTGTAGATGTATATTAAATGTTATATGAAATAAATAAATATGTAAGCGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 

ORF

 ATGTGGTTAAGTGTATTATTAGTGGTGATTTTACTGTTTTTGATTCTGTTGTTAACCGTGTTTCACTATACGACTAAAGGAAGAAAATATTGGTTGTTACGAAATGTACCTTACAGAGAACCATGTCCGTTATTTGGAAATTTTGGAGCAACGTTCACTATGAGGAGAAGCTACACAAAAATGTTGCAATTTTTTTACGATAATTATTATAATGAGAAATACGTGGGAATTTTTCAAGCACGGAGGCCGACATTAATGCTCATAGATTTAGAACTGGTGAAAAATGTATTATCTAAAGAATTTCCGAATTTCAGCGATCGCATATCTGTTACGACCGATACGCAGCGGGAACCATTGCTTCGGAATTTAGCTAATATGAGTGGAGCTGAATGGAAAGCTATGAGGCAGATTGTAACGCCAACATTTTCATCGGCGAAAATGAAAGCTATGTTTCCATTGATAGCGGAATGTGCTCAAACATTAAAAAATAGTCTACTTAAGGAGTCTCTCGCGGAAGTTAATGTGCCCGATTTTATGACACGATTTACTACAGACGTAATTGGTAGTTGTGCCTTCGGAGTCGACCCTGGTTCTCTGAAAGATCCCGAGTCTCCATTCTTAAAAATGTCGCAAAAAATGTTTAAAATTGATCGTTCTACTGTTTTAAAACGCTATTGTAGAACGTTTTTCCCAAAGCTGTTTAAATTTTTGAATCTCAGAACATACTCAAAGGATGTGGAAACGTTTTTCACAACTATTATTAAGAAAGTTCTCGATGAAAGGCGCGCCACGGGCGTTCAAAGACATGACTTCCTACAGCTTATGTTGAACGTTCAGAAAACTGAAACAAGTTTCGTTATGACCGACACATTGATAATATCGAATTCGTTCATTTTTATGCTCGCTGGACTAGAATCCTCGTCTACTACACTATCGTTCTGTTTATATGAATTGGCTAAAGATAAACACATCCAAGATGATCTCAGAACAGAGATTGTTGACTGCTTAGAAAGGTATGGTGGTATAAATTATGAAGCAGTGTGTTCAATGCGCTTGGTCAACCAAGCTGTACTTGAGACTTTACGACTTCATCCACCGACGCCGCTCACGACACGGCTTTGCACCAGTGCTTGTACTCTGAATGGCACAGATTTAAGCGTTAGAGTAAGAGATCCCGTGTTAATACCTTTGTATTGTATTCAGCGAGACGCCCAACACTTTCCTAATCCTGACAAGTTCAATCTAGAAAGGTTTAAGGAAACAAATCCTCCTGGATTTTTGGCTTTCGGCGAAGGACCGAGGAGTTGTCCAGGCGCACGATTTGCTCAATTGACAGTTGCCGCGGCTCTTGCGGCTTTGCTAAGTAGTTTTGAAATAGAACCTTGTTCCATGACAACTTCCACTATAGTCTATGATCCTAGAAGTGTAATGCTTAAGAATAAAGGCGGGATATGGCTGAAATTTGTACCTCTATAA 

Protein

 MWLSVLLVVILLFLILLLTVFHYTTKGRKYWLLRNVPYREPCPLFGNFGATFTMRRSYTKMLQFFYDNYYNEKYVGIFQARRPTLMLIDLELVKNVLSKEFPNFSDRISVTTDTQREPLLRNLANMSGAEWKAMRQIVTPTFSSAKMKAMFPLIAECAQTLKNSLLKESLAEVNVPDFMTRFTTDVIGSCAFGVDPGSLKDPESPFLKMSQKMFKIDRSTVLKRYCRTFFPKLFKFLNLRTYSKDVETFFTTIIKKVLDERRATGVQRHDFLQLMLNVQKTETSFVMTDTLIISNSFIFMLAGLESSSTTLSFCLYELAKDKHIQDDLRTEIVDCLERYGGINYEAVCSMRLVNQAVLETLRLHPPTPLTTRLCTSACTLNGTDLSVRVRDPVLIPLYCIQRDAQHFPNPDKFNLERFKETNPPGFLAFGEGPRSCPGARFAQLTVAAALAALLSSFEIEPCSMTTSTIVYDPRSVMLKNKGGIWLKFVPL* 

Auto annotation result

Program/Analysis	Accession	Description	Score/Expectation
Pfam/Hmmer3	PF00067.17	Cytochrome P450
BLASTP/NCBI-nr	ADM63092	cyp6u1 [Bombyx mori]	0.0
InterPro	IPR001128	Cyt_P450
InterPro	IPR002401	Cyt_P450_E_grp-I
InterPro	IPR017972	Cyt_P450_CS
Gene Ontology(MF)	GO:0009055	electron carrier activity
Gene Ontology(MF)	GO:0020037	heme binding
Gene Ontology(MF)	GO:0016705	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
Gene Ontology(MF)	GO:0005506	iron ion binding
Gene Ontology(BP)	GO:0055114	oxidation-reduction process

Expression data (EST count)

Paralog/Ortholog genes

Paralogous genes

Gene ID	Official gene ID	Chr.	Chr. start	Chr. end	Scaffold ID	Start	End	Direction
Gene05563	BMgn006784	chr10	6845304	6861637	Bm_scaf10	6845304	6861637	+

Orthologous genes

Species	Gene ID	Scaffold ID	Start	End	Direction
D. plexippus	DPOGS213799	DPSCF300106	110689	125797	-
D. plexippus	DPOGS213800	DPSCF300106	97352	110422	-
H. melpomene	HMEL012899	HE671316	60416	70920	+
M. sexta	Msex001592-RA	scaffold00017	775116	820462	-
P. xylostella	Px000860.1	scaffold_109	1859443	1917456	-
P. xylostella	Px015446.1	scaffold_712	5069	39381	+
P. xylostella	Px015447.4	scaffold_712	47919	65879	+