KAIKObase gene description page [BMgn015914/Gene07310]
Outline
| Official gene ID | BMgn015914 |
|---|---|
| Local gene ID | Gene07310 |
| Chromosome | chr12 |
| Start (Chr.) | 13009710 |
| End (Chr.) | 13011656 |
| Scaffold | Bm_scaf109 |
| Start (Scaf.) | 70094 |
| End (Scaf.) | 72040 |
| Direction | + |
Member sequences
| ID | Type | Representative |
|---|---|---|
| AK380529 | full-length cDNA | Yes |
Representative sequence
Nucleotide
TAAATGAATTTTCCCTTTACTGTAGAAAACACTCACAACTACATTTTCACTAAACTTGGTCACACTAATTATGCTCGATGCTACAGATTCATTACGCGTGGTCCGACACGTGACTGCCCGGCTTTATTGAACAGCTGTCTTTCAGAAATGGACAAGACTGCCATCACAATTTGAATGGCCTATGATTATTATTTAGCATTTACAAAGTTTTATTAGATATTGTTCGTAAAGTATTCTGATATTCAATATATTATTATGTATATCCATGATTTACTCAGACTACTAACATATTATATTGGTAGAATCACTATCCTCATATTTTTTAAATATGGTTGTATTATCTTTTGAAGAAATACTTCAAGCAAATTGTCACAGTAGGAGCAGATGCAATTTTTAGATCATTTGTTTCAATTTAACATGGTTTTTCTGTTTCGTAAAGGTTTTGATTAATGTTTAACTTATAGTTTAATTTTTTTATTTATTTATAATGTAGGTACTTTGCAGAGTTGATTGGAAAAGTTTCTTGAATTTAAAACTTTAGTAGCAAGGCTCCATTTTGGGAAAACTATTGAAACATTATTTTTAATAATGCTATTTTTACTTTTCAAACTAATGATACATTAAAGTTAAAATCGATAATTCTGTGTACCATGGTTAACCTCACAATATTCTAATAGCATTTATAGTTGTAAAAAATGTATATAATAATACTTACGAATGTTAATATTTTTATTACAGGACTGTAATAATTCGCATTGTAGACTTCCTTTTCTCCGTTTGAAGATAAATGGACTGCTACACCCAAGTCCACAAATTTCAAAACTATTAAAAGACATGTTACTAGCAATTTCGTGATGTTCAGTATGTTCCATGGTATATTTCGTTCCTTACTATTGAATATGTAATATAAGTCAAGGAATGCAAACACCCAGAGATAGAGACAGGGTGTCCAAATGAGGACAGTCTGCTGGAAACATGGTGTTAGTTCAGGATTATCCGTGTACCAGGTGGCAGTACTGTTCTGTAAATTAAAAAGATTATTTTTCAATTACTGGCTGAAAATTATCTCTTCAATTAATAATCAGATAATTTGTCTTATCTTTCATGTTTACATATAAACACAAATTAAACACCATGCTTTTAGTTACTCACTAATGAAGAATCATTCTCCCCATTTAGCTTATAACATAATAATCATCTTCTGATTTAATAAATTATGATTTTATCAAGCTTAGAAGATTGTAAAAGTTTTCTAGTAATCAATTTCACATTTTTAAACTAAAATAAAACTTTTTCATTGACTAACAGTATTCCTGAATAAACAATAAATATATTTTTTTAAAGAAAAACTAGTATAAAAGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ORF
ATGGAACATACTGAACATCACGAAATTGCTAGTAACATGTCTTTTAATAGTTTTGAAATTTGTGGACTTGGGTGTAGCAGTCCATTTATCTTCAAACGGAGAAAAGGAAGTCTACAATGCGAATTATTACAGTCCTGTAATAAAAATATTAACATTCGTAAGTATTATTATATACATTTTTTACAACTATAA
Protein
MEHTEHHEIASNMSFNSFEICGLGCSSPFIFKRRKGSLQCELLQSCNKNINIRKYYYIHFLQL*
Auto annotation result
| Program/Analysis | Accession | Description | Score/Expectation |
|---|---|---|---|
| Pfam/Hmmer3 | PF02408.15 | CUB-like domain | |
| BLASTP/NCBI-nr | NA | No hit found | NA |
Expression data (EST count)
Paralog/Ortholog genes
Paralogous genes
| Gene ID | Official gene ID | Chr. | Chr. start | Chr. end | Scaffold ID | Start | End | Direction |
|---|
Orthologous genes
| Species | Gene ID | Scaffold ID | Start | End | Direction |
|---|