- 2010年6月30日
- KAIKOGAASで予測した遺伝子モデルをKAIKObaseに格納しました。
- KAIKObaseのGBrowse上にある"KAIKOGA"遺伝子モデルからKAIKOGAASのScaffold segment IDにリンクしました。
- 2010年6月29日
- Scaffold build2配列をKAIKOGAASで処理し、KAIKOGAASデータベースに格納しました。
- KAIKOGAASの説明文を変更しました。
- 解析ツールにあるKAIKOGAASの説明文を変更しました。
- 公開データにKAIKOGAASを追加しました。
- 2010年6月11日
- 参考文献の刊行物のページを更新しました。
- 2009年 2月 6日
- KAIKObaseのトップページのレイアウトを変更しました。
- 2009年 1月21日
- カイコ遺伝子モデル配列をKAIKOblastデータベースに追加しました。
- KAIKOblastにある配列検索機能はKAIKObaseに含まれるため、KAIKOblastに
ある配列検索機能を削除しました。
- 2009年 1月19日
- KAIKObaseの更新履歴がKAIKObaseのホームページからアクセスできます。
- カイコ由来でないジャンク配列をApril 2004のKAIKOcontig.txt.gzから削除しました。
- カイコ由来でないジャンク配列をKAIKOblastデータベースの"Assemble results
of Japanese WGS sequence, in Apr. 2004"から削除しました。
- 2009年 1月13日
- Bombyx Trap DataBaseの連絡先メールアドレスを変更しました。
- 2009年 1月 8日
- KAIKObase version2は、"Bombyx Trap DataBase"と"KAIKO 2D DataBase
(proteome)"へのリンクを追加しています。
いくつかのインタフェースも改良しています。詳細は、KAIKObaseのホームペー
ジをご覧ください。
- トランスポゾンを挿入した系(強制発現系統や遺伝子発現系統)のトランスポ
ゾンベクタ(ミューテータ)の位置やレポータの発現の情報を提供する "Bombyx
Trap DataBase" を"Public Data"ページに追加しました。
- 日中共同研究から得られた遺伝子モデルを使った解析結果を"KAIKO 2D
DataBase (proteome)"に追加しました。また、Make2D-DB II packageのバージョン
を1.00.aから2.50.1に更新しました。
- "Genomic Sequences" からダウンロード可能なデータ一覧に"Repeat sequence"を追加しました。
- "Repeat sequence" をKAIKOBLASTのデータベースに追加しました。
- 2008年 9月30日
- ゲノム配列ページの染色体毎にまとめたスキャフォールドおよびコンティグ(integretedseq.txt.gz)に誤りが見つかったため、修正したものに入れ替えました。
- 2008年 7月24日
- ゲノム配列(Genomic Sequences)ページをリニューアルしました。
- 2008年 5月30日
- GLEANを使用した全遺伝子セットファイル(glean_cds.txt.gz, glean_pro.txt.gz)内の遺伝子IDから末尾の"TA"と"PA"を削除しました。新しいファイルは「ゲノム配列 (Genomic Sequences)」のページからダウンロードできます。
- 2008年 4月21日
- 日中のホールゲノムショットガンデータの統合により得られたカイコゲノム配
列は、RAMENアセンブラでアセンブルされたコンティグ、スキャフォールドなど
のダウンロードできるデータセットとして、Public dataページに追加しました。
- KAIKObase 統合化されたカイコゲノムデータベースをKAIKObaseページに追加
更新しました。
- アセンブルされたカイコゲノムの統計データをSequence ページに追加しました。
- BombmapをPublic Dataページに移動しました。
- KAIKOBLASTデータベースにアセンブルされたセット (重複が無く一つにまとめ
られたスキャフォールドおよびコンティグ)を追加しました。
- 2008年 3月19日
- "Wild Silkbase: An EST database of wild silkmoths"をLinkページに追加しました。
- 2008年 1月30日
- 1,755個のSNPsで構築したlinikage mapをPublic Dataページに追加しました。
- 2007年 9月19日
- KAIKOBLASTホームページのデザインを変更しました。
- BAC_end配列のデータをKAIKOBLASTに追加しました。
- 2006年10月24日
- 2つのFgeneshのパラメータ (Apis mellifera, Tribolium castaneum)とGFSelectorK (Gene Function Selector for KAIKO) が、KAIKOGAASに追加された。
- 2006年9月4日
- カイコゲノム研究プログラムホームページ(日本語版)をオープンしました。
- 2003年12月15日
- 農業生物資源研究所のカイコゲノム研究プログラム(SGP : Silkworm Genome research Program)ホームページ(英語版)をオープンしました。
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