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新着情報

  • 2010年6月30日
    - KAIKOGAASで予測した遺伝子モデルをKAIKObaseに格納しました。
    - KAIKObaseのGBrowse上にある"KAIKOGA"遺伝子モデルからKAIKOGAASのScaffold segment IDにリンクしました。


  • 2010年6月29日
    - Scaffold build2配列をKAIKOGAASで処理し、KAIKOGAASデータベースに格納しました。
    - KAIKOGAASの説明文を変更しました。
    - 解析ツールにあるKAIKOGAASの説明文を変更しました。
    - 公開データにKAIKOGAASを追加しました。


  • 2010年6月11日
    - 参考文献の刊行物のページを更新しました。


  • 2009年 2月 6日
    - KAIKObaseのトップページのレイアウトを変更しました。


  • 2009年 1月21日
    - カイコ遺伝子モデル配列をKAIKOblastデータベースに追加しました。
    - KAIKOblastにある配列検索機能はKAIKObaseに含まれるため、KAIKOblastに ある配列検索機能を削除しました。


  • 2009年 1月19日
    - KAIKObaseの更新履歴がKAIKObaseのホームページからアクセスできます。

    - カイコ由来でないジャンク配列をApril 2004のKAIKOcontig.txt.gzから削除しました。
    - カイコ由来でないジャンク配列をKAIKOblastデータベースの"Assemble results of Japanese WGS sequence, in Apr. 2004"から削除しました。


  • 2009年 1月13日
    - Bombyx Trap DataBaseの連絡先メールアドレスを変更しました。


  • 2009年 1月 8日
    - KAIKObase version2は、"Bombyx Trap DataBase"と"KAIKO 2D DataBase (proteome)"へのリンクを追加しています。 いくつかのインタフェースも改良しています。詳細は、KAIKObaseのホームペー ジをご覧ください。

    - トランスポゾンを挿入した系(強制発現系統や遺伝子発現系統)のトランスポ ゾンベクタ(ミューテータ)の位置やレポータの発現の情報を提供する "Bombyx Trap DataBase" を"Public Data"ページに追加しました。
    - 日中共同研究から得られた遺伝子モデルを使った解析結果を"KAIKO 2D DataBase (proteome)"に追加しました。また、Make2D-DB II packageのバージョン を1.00.aから2.50.1に更新しました。

    - "Genomic Sequences" からダウンロード可能なデータ一覧に"Repeat sequence"を追加しました。
    - "Repeat sequence" をKAIKOBLASTのデータベースに追加しました。


  • 2008年 9月30日
    - ゲノム配列ページの染色体毎にまとめたスキャフォールドおよびコンティグ(integretedseq.txt.gz)に誤りが見つかったため、修正したものに入れ替えました。


  • 2008年 7月24日
    - ゲノム配列(Genomic Sequences)ページをリニューアルしました。


  • 2008年 5月30日
    - GLEANを使用した全遺伝子セットファイル(glean_cds.txt.gz, glean_pro.txt.gz)内の遺伝子IDから末尾の"TA"と"PA"を削除しました。新しいファイルは「ゲノム配列 (Genomic Sequences)」のページからダウンロードできます。


  • 2008年 4月21日
    - 日中のホールゲノムショットガンデータの統合により得られたカイコゲノム配 列は、RAMENアセンブラでアセンブルされたコンティグ、スキャフォールドなど のダウンロードできるデータセットとして、Public dataページに追加しました。
    - KAIKObase 統合化されたカイコゲノムデータベースをKAIKObaseページに追加 更新しました。
    - アセンブルされたカイコゲノムの統計データをSequence ページに追加しました。
    - BombmapをPublic Dataページに移動しました。
    - KAIKOBLASTデータベースにアセンブルされたセット (重複が無く一つにまとめ られたスキャフォールドおよびコンティグ)を追加しました。


  • 2008年 3月19日
    - "Wild Silkbase: An EST database of wild silkmoths"をLinkページに追加しました。


  • 2008年 1月30日
    - 1,755個のSNPsで構築したlinikage mapをPublic Dataページに追加しました。


  • 2007年 9月19日
    - KAIKOBLASTホームページのデザインを変更しました。
    - BAC_end配列のデータをKAIKOBLASTに追加しました。


  • 2006年10月24日
    - 2つのFgeneshのパラメータ (Apis mellifera, Tribolium castaneum)とGFSelectorK (Gene Function Selector for KAIKO) が、KAIKOGAASに追加された。


  • 2006年9月4日
    - カイコゲノム研究プログラムホームページ(日本語版)をオープンしました。


  • 2003年12月15日
    - 農業生物資源研究所のカイコゲノム研究プログラム(SGP : Silkworm Genome research Program)ホームページ(英語版)をオープンしました。